蛛网膜囊肿在原发性脑内囊肿中很常见。蛛网膜囊肿通常由先天性发育期间局部蛛网膜下腔脑脊液循环的部分循环引起，导致脑脊液局部保留并积聚囊肿。事实上，囊肿内的成分是脑脊液，它是正常的脑脊液。一些继发性囊肿，例如肿瘤，通常是肿瘤结节，其本身是分泌的并且可以分泌液体。逐渐包裹后，随着分泌液逐渐增加，囊肿逐渐扩大。一些寄生虫也会产生分泌液，这些分泌液被炎症刺激所包裹，导致囊肿逐渐增加。