慢性扁桃体炎是急性扁桃体反复发生，还有细菌滋生引起，还与自身变态反应有关。慢性扁桃体炎主要原因是急性扁桃体反复发生，可能每年发作3到4次，连续2年被称为慢性扁桃体炎。还有扁桃体隐窝，患者引流不畅造成病毒、细菌滋生引起慢性扁桃体炎。目前致病菌主要包括链球菌和葡萄球菌，这是治病方面。还有目前研究发现慢性扁桃体炎与自身变态反应有一定关系。