龟头上长水泡有两个方面的原因：1、其中最多见的原因，有病毒感染造成的症状，可能是生殖器疱疹，也不完全排除带状疱疹。可以口服抗病毒药物，在患处的局部地方涂抹抗感染的药物进行治疗。2、由于包皮龟头炎症造成龟头红肿和充血。可以到医院做一下真菌镜检明确诊断，局部可以外用抗真菌的药膏。用药时需要在医生的指导下进行，不能私自用药。生殖器疱疹经过性接触传播，在患病期间不能同房。这种疾病有自限性，但是容易复发，平时要注意个人的卫生情况。