肛瘘和痔疮都是临床上直肠肛管非常多见的良性疾病。两者的区别主要表目前以下几点：第一、肛瘘正常是上肛管周围间隙慢性感染所形成的窦道、而痔疮并非感染性疾病，是因为直肠肛管静脉回流障碍所造成。第二，从治疗上来说，痔疮主要采用保守治疗不求根治，而肛瘘必须采用手术治疗务必使瘘管创面全部敞开。第三，从预后来说，痔疮如果生活习惯不好，正常容易复发，而肛瘘只要创面彻底敞开，正常可以获得治愈，很少表现出复发。