黄连素的副作用通常有以下几种：一、对胃部造成刺激，导致胃酸分泌量增多，出现胃部反酸等症状。还可能因此影响肠胃的消化情况，出现便秘、恶心、呕吐等症状。二、部分患者使用后会出现横纹肌溶解现象，导致腿部出现疼痛感，还可能出现乳酸性酸中毒。三、若是长期使用黄连素，可能会对体内维生素的吸收造成影响，导致身体免疫力下降。因此，应该遵医嘱定时定量使用黄连素。