蛋白酶对人体首先能起到消化蛋白质的作用，通过水解将蛋白质分解成多肽，然后多肽经过肽酶水解为氨基酸最后被人体小肠的上皮细胞吸收。其次对人体还能起到改善消化不良的作用，当人体出现胃蛋白酶缺乏时，摄入的蛋白质无法有效分解，从而增加肠胃的负担造成消化不良，此时补充蛋白酶能帮助蛋白质快速水解，可以改善消化不良的症状，但需要在医生指导下用药。