肺炎衣原体抗体阴性的意思是患者的肺炎不是感染衣原体的病菌引起的。肺炎分为细菌性、病毒性和非典型病原体所致肺炎，细菌和病毒性肺炎通常是由于肺部吸入外部环境的空气后，细菌病毒突破呼吸道免疫防御在人体内部滋生引起肺部充血、水肿、发炎。而肺炎衣原体感染则通过肺炎衣原体患者的飞沫传播，因此需要检查患者肺炎衣原体抗体来进行区分和对症治疗。