先天性肛门闭锁不及时治疗会导致肠梗阻、肠坏死，甚至导致婴幼儿死亡。但如果及时治疗，宝宝长大以后基本没有什么影响。先天性肛门闭锁，如果不及时治疗，会引起肠梗阻、肠坏死，甚至导致婴幼儿死亡，危及生命。但如果发现后及时治疗，宝宝长大以后基本没有什么影响，?不会影响到宝宝营养状况和生长发育。因此，家长一旦发现宝宝有先天性肛门闭锁，应及时前往当地正规医院就诊治疗。