十六岁女孩月经不规律是比较多见的，一般说明卵巢功能尚不成熟，没有排卵、没有周期性的雌孕激素变化，就会表现出月经不规律。可以给予雌孕激素周期替代治疗，也可以选择短效口服避孕药替代治疗，简单、方便。替代治疗期间月经会变得非常规律，但常常停药后会表现出病情反复，只有女性到一定年龄段，有规律性排卵、规律性雌孕激素分泌之后才可以真正好转。如果十六岁女孩月经不规律，但没有表现出经量过多等阴道大出血表现，对机体没有特别影响，也可以暂时不治疗，一般等待几年之后待女性成熟以后就会自然好转。