附睾囊肿一般情况下是不会影响生育的，睾丸功能并不受到附睾的影响，但如果患者附睾囊肿的直径非常大，会压迫睾丸组织，此时就会导致睾丸功能下降，影响精子的质量，严重时也会降低男性的性功能。如果患者合并出现疼痛的症状，要口服非甾体抗炎镇痛的药物治疗，例如布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等。如果囊肿直径过大，就要采取手术治疗，例如附睾囊肿切除术。