手足口病急性期有颅内压增高的可以使用甘露醇等药物降低颅内压，必要时可以使用呋塞米等利尿剂，有的需要使用糖皮质激素类药物，比如氢化可的松、地塞米松等。对于有血流动力学改变的患者，可以使用血管活性药物。手足口病早期还可以使用干扰素进行抗病毒治疗。此外，还可以考虑中医治疗，辨证施治，高热持续者可以服用清瘟败毒饮。治疗期间还需要加强护理，避免患者与外界接触。