血清高密度脂蛋白胆固醇偏低也许是错误的饮食习惯造成，例如经常吃油腻食物、动物肝脏类的食物等。其次，考虑是患有糖尿病、高尿酸血症或是肾病综合征、甲减等疾病而诱发的症状。此外，也可能是内分泌紊乱所致。若是身体过度劳累、频繁熬夜、长期精神压力大，都可能导致内分泌系统紊乱。此外，如果患者存在动脉粥样硬化的现象，也可能导致血清高密度脂蛋白胆固醇偏低。