咳嗽的时候小腹疼痛也许是咳嗽程度过于剧烈，腹内压增大，所以腹部肌肉出现震动，并且不断膨胀收缩，导致肌肉组织出现充血水肿现象，诱发疼痛感。其次，可能是患有附件炎、盆腔炎等妇科疾病而出现的腹痛感。也可能是患有胃肠炎、胃痉挛、肠痉挛等疾病，因此在出现咳嗽症之后对身体造成刺激，导致疼痛感加重。建议至医院进行腹部彩超等检查，明确具体的病因。