喝咖啡肚子疼可能与以下原因有关：一、摄入过量，咖啡可以促进胃肠道蠕动，提高消化能力，但是如果摄入过量，可能会产生刺激，引起疼痛等不适症状。二、空腹饮用。如果患者在空腹的状态下饮用，咖啡对胃肠道的刺激会明显增加，出现腹痛等症状。三、胃肠道疾病。如果患者本身存在胃炎、胃溃疡等疾病，患病期间饮用咖啡会直接加重病情。四、咖啡过期或者变质，细菌等微生物进入胃肠道，诱发急性肠胃炎等疾病。