硼砂溶液具有消毒、防腐的作用。临床上硼砂水一般指复方硼砂溶液，主要用于漱口，可以用于治疗口腔炎、扁桃体炎、咽炎等疾病，能够冲刷口腔中的细菌，清洁口腔，减少局部细菌滋生，缓解咽喉疼痛、口腔异味等不适症状。但是药物具有一定的刺激性，因此在含漱的过程中避免吞咽，药物进入胃肠道中会对胃黏膜产生刺激，引起胃痛、恶心、呕吐等不适症状，甚至会引起急性中毒。