韩国海关对于厨师证的审查主要是为了确保外国人在韩国合法工作，以及遵守韩国的相关法律法规，根据韩国法律规定，持有厨师证的外国人在韩国工作时需要进行一定的登记和审批，如果没有按照规定进行登记和审批，可能会面临罚款甚至被驱逐出境的风险。

关于厨师证去韩国海关会扣钱的问题，具体情况需要根据您所持有的厨师证类型、签证类型以及您的入境目的等因素来判断，如果您是持旅游签证前往韩国，那么在入境时海关官员可能会要求您提供相关的工作许可证明，以证明您有合法的工作权益，如果您无法提供这些证明材料，可能会被拒绝入境或者被要求支付一定的罚款。

如果您是持工作签证前往韩国，那么在入境时海关官员会对您的厨师证进行审核，如果证件齐全、无误，并且符合韩国的相关法律法规要求，那么您应该不会受到任何影响，如果您的厨师证存在问题，比如过期、伪造等，那么海关官员可能会要求您补办或者被拒绝入境，并可能面临一定的罚款。

在前往韩国之前，建议您提前了解相关的法律法规要求，并确保您的厨师证和其他相关材料都是齐全、有效的，您还可以咨询当地的韩国使领馆或者专业的签证中介机构，以获取更加详细和准确的信息和建议。