孕酮低有胎心胎芽不一定会胎停。孕酮低是女性在怀孕期间比较常见的现象，如果孕酮低的程度比较轻微，孕妇及时的使用补充孕酮的药物，经过正规的治疗后一般是不会发生胎停的。但如果孕妇孕酮低的程度比较严重，本身体质也比较差，即使存在胎心胎芽也容易发生胎停。孕酮低的孕妇应调整好心理状态，尽早去妇产科就诊，密切的进行胎心监护，明确胎儿在宫腔内的具体情况，注意休息，减少活动量。