偏头痛发病机制很复杂，近年来，人们普遍认为的机制是，在诱导因子作用于中枢神经系统后，神经递质通过单胺类途径发生变化，进而激活血小板，导致5-HT和血栓素A2（TXA2）的释放和消耗，导致血小板收缩和表达。而颅内和颅外血管的密集，血管壁吸附5-HT产生，释放组胺、缓激肽和其他参与过敏反应的因子，使血管扩张，发生头痛及其神经血管反应。