手指关节疼主要有两方面的原因：1、类风湿性关节炎，是人体的自身免疫性疾病，由于自身的免疫系统对自身的组织产生免疫反应，造成在手的小关节位置表现出炎症堆积，造成软骨退变、骨性的增生以及手指的畸形，会造成手指关节位置受到炎症病灶的刺激，表现出明显的疼痛感。2、手指头关节部位表现出拉伤、劳损以及反复的受凉，形成无菌性炎症病灶，特别是受凉之后炎性代谢产物表现出堆积，对周围的关节会产生刺激影响，而表现出疼痛感。并且在进行手指头活动的时候，由于损伤的位置会受到牵拉和刺激，会造成炎性水肿进一步加重，对周围刺激更加明显，疼痛的症状更加明显。