脑干胶质瘤以手术、放疗以及化疗等综合方式治疗为主。如果患者处于疾病早期阶段，肿瘤体积较小，可以通过手术方式将瘤体全部切除，可以缓解胶质瘤引起的头痛等临床症状。除此之外，如果瘤体较大或生长部位靠近脑干，无法完全切除，也可以结合放疗以及化疗，尽量将肿瘤组织消除。对于存在脑积水或颅压高的患者，应该给予减压术治疗。对于存在致癌位点的患者，也可以给予靶向治疗。